CS | en

Vyhledávání

Celý intranet Aktuální oblast


Důležité odkazy

dulezite-biocev.pngdulezite-avcr.pngdulezite-ov.pngdulezite-tvt.png

Vědecká pracoviště

 

Postdoktorand - Laboratoř biomolekulárního rozpoznávání

 

Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. vyhlašuje v souladu se zákonem č. 283/1999 Sb. o Akademii věd České republiky, ve znění zákona č. 420/2005 Sb. a se Stanovami AV ČR výběrové řízení na pozici postdoktoranda v oboru molekulární a buněčné biologie na plný úvazek.

 

Náplň práce:

  • metody molekulární a buněčné biologie
  • příprava a purifikace proteinů, jejich charakterizace včetně pokročilých biofyzikálních metod a krystalografie

 

Požadujeme:

  • VŠ vzdělání přírodovědného směru, vědecká hodnost Ph.D.
  • praktická znalost pokročilých biofyzikálních experimentálních metod a krystalografie
  • komunikační a organizační schopnosti
  • angličtina slovem i písmem

 

Nabízíme:

  • odpovídající finanční ohodnocení
  • 5 týdnů dovolené
  • stravenky

 

Místo výkonu práce: Vestec, Praha – západ, v rámci excelentního výzkumného centra BIOCEV – více na www.biocev.eu

 

Nástup: 1. 7. 2018

 

Písemné přihlášky zahrnující motivační dopis a strukturovaný profesní životopis, obojí v češtině i angličtině, jsou přijímány na e-mailu: veronika.popova@ibt.cas.cz

                                                                                                                                             

Uzávěrka přijímání přihlášek: 11.6.2018

                                                                                                                

Skupina Nádorové rezistence, Biotechnologický ústav AV ČR, hledá

 

PhD studenta

 

pro výzkumný projekt „Protinádorové účinky mitochondriálně cíleného deferoxaminu“, který si klade za cíl definovat vliv deferoxaminu cíleného do mitochondrií na proliferaci, migraci a invazivitu nádorových buněk in vitro. Součástí práce je i testování vlivu nově syntetizovaných mitochondriálně cílených látek na iniciaci a progresi nádorů u myší in vivo.

 

Požadavky

  • ukončené vzdělání v oboru molekulární biologie, vývojová, buněčná biologie, nebo biochemie (Mgr.)
  • pracovník na této pozici musí splňovat podmínku prezenčního Ph.D. studia
  • schopnost komunikovat v anglickém jazyce na úrovni vypsané pozice
  • chuť aktivně se podílet na rozvoji pracoviště a zapojit se do týmu týmové práce

 

Nabízíme

  • pracovní pozici Ph.D. student s úvazkem min. 0,6; grantová podpora GA ČR na dobu 3 let
  • účast na mezinárodních konferencích
  • pracoviště v budově Biotechnologického ústavu AV ČR v moderně vybavené laboratoři v centru BIOCEV
  • při řešení projektu se budou používat moderní metody molekulární biologie včetně in vitro pěstování rakovinných buněk, qPCR, techniky genových manipulací CRISPR, in vivo pokusy na myších modelech

V případě zájmu zašlete, prosím, svoji přihlášku se strukturovaným životopisem na email jaroslav.truksa@ibt.cas.cz.

                                                                                                                

PhD student position

 

Engineered antibodies as theranostics for cancer imaging and therapy

 

Summary

Monoclonal antibodies (mAbs) often need to be engineered to circumvent their inherent limitations. We have recently developed and patented the 5D3 mAb that specifically recognizes prostate-specific membrane antigen (PSMA), an established cancer marker. The project is aimed at the protein engineering efforts to prepare different types of 5D3 derivatives that will be incorporated into several experimental platforms targeting PSMA-positive tumors in vitro and in vivo.

 

Project

Parent 5D3 will be engineered into several types of derivatives including single chain variable fragments Fab fragments and diabodies. They will be heterologously overexpressed and purified and their biophysical, biological and structural characteristics evaluated. The best performing derivatives will be then incorporated into three distinct platforms to assess their potential for cancer management: (i) chelator fusions loaded with imaging and therapeutically relevant metals; (ii) cytotoxic fusions; and (iii) BiTE (bispecific T-cell engagers) fusions that elicit cytotoxic effects by retargeting immune cells to PSMA-positive tumors. The fusion platforms will be evaluated in a series of in vitro assays and the efficacy of the most promising candidates assessed in vivo using the mouse xenograft model of prostate cancer.

 

Methodology

Used methodology includes cloning, mutagenesis, heterologous protein expression in various systems (E.coli, insect and mammalian cells), and protein purification. Biophysical/structural characterization includes microscale thermophoresis, ELISA, SPR, nanoDSF, and X-ray crystallography. Immunofluorescence microscopy, FACS, cytotoxic assays, ROS production monitoring will be used for cell-based (immunological) assays. The project is supported by the grant from the Czech Science Foundation and will be carried out in collaboration with M. Pomper lab, Johns Hopkins Medical Institutions, Baltimore, USA.

 

Qualifications

Applicants should have a solid background in molecular biology and biochemistry or cell biology. We expect good communication skills, analytical thinking and the ability for teamwork. The successful candidate will participate in a PhD program at Charles University in Prague. The starting date is summer/fall 2018.

 

How to apply: For more information please contact Cyril Bařinka (cyril.barinka@ibt.cas.cz) directly.

 

Cyril Barinka, PhD
Laboratory of Structural Biology
Institute of Biotechnology CAS
BIOCEV, Centre of Excellence
25250 Vestec u Prahy
http://lsb.avcr.cz/

                                                                                                                

PhD student position

 

Physiological functions og GCPII orthologs in basal organisms

 

Summary

Human glutamate carboxypeptidase II (GCPII) is a zinc-dependent peptidase that is increasingly recognized as a target of therapeutic interventions in a variety of neurologic disorders as well as a marker for imaging and therapy of prostate cancer. However, despite of nearly universal expression of GCPII-like proteins in living organism there is limited knowledge of physiological function(s) of such orthologs in non-mammalian species.

 

Project

The project focuses on structure-function and enzymologic studies of non-mammalian orthologs of human GCPII, including enzymes from C.elegans, F.hepatica, D.rerio, A.thaliana, S.mansoni and yeast species. Used methodology includes cloning strategies (Gateway), mutagenesis, heterologous protein expression in various systems (E.coli, K.lactis, insect and mammalian cells), protein purification and characterization, enzymatic assays including high-throughput library screening, inhibition studies, cell biology (fluorescent microscopy), and X-ray crystallography. We believe that unravelling physiological function(s) of these proteins in non-mammalian species could shed light unto yet unknown functions of the protein in mammals, including humans. The project is supported by the grant from the Czech Science Foundation and will be carried out in collaboration with J. Dvorak lab, Czech University of Life Sciences in Prague.

 

Qualifications

Applicants should have a solid background in molecular biology and biochemistry or cell biology. We expect good communication skills, analytical thinking and the ability for teamwork. The successful candidate will participate in a PhD program at Charles University in Prague. The starting date is summer/fall 2018.

 

How to apply: For more information please contact Cyril Bařinka (cyril.barinka@ibt.cas.cz) directly.

 

Cyril Barinka, PhD
Laboratory of Structural Biology
Institute of Biotechnology CAS
BIOCEV, Centre of Excellence
25250 Vestec u Prahy
http://lsb.avcr.cz/

                                                                                                                

Bioinformatik pro servisní laboratoř GeneCore

 

Do našeho týmu hledáme zkušeného bioinformatika pro servisní laboratoř GeneCore Biotechnologického ústavu AV ČR, v. v. i. v BIOCEVu, která je předním evropským pracovištěm nabízející qPCR a NGS služby.

 

Náplň práce

Bioinformatik bude pracovat na projektech klientů GeneCore z akademické i komerční sféry, které zahrnují především statistické spracováni dat při analýze RNA-Seq a genové exprese. Ve spolupráci s s TATAA Biocenter (www.tataa.com) bude mít možnost podílet se na vyučování kurzů.

 

Požadavky

  • Znalost programovacích jazyků běžně používaných v bioinformatických analýzách (R, Python...)
  • Zkušenost s analýzou NGS dat výhodou (především RNA-Seq)
  • Vysokoškolské vzdělání příslušnéo směru (lze i během studia)
  • Zájem o technologie a analytické metody pro molekulární biologii
  • Schopnost pracovat jak samostatně, tak ve skupině
  • Spolehlivost a flexibilita
  • Chuť do práce a odhodlání učit se novým věcem

 

Nabízíme

  • Částečný úvazek nebo DPP (možnost home-office)
  • Odpovídající platové ohodnocení
  • Atraktivní pracovní prostředí moedrního vědeckého centra
  • Přátelský mezinárodní kolektiv
  • Pět týdnů dovolené a další zaměstnanecké benefity (dle typu a velikosti úvazku)

 

Kontaktní informace: Svoji žádost spolu s životopisem, prosím, zašlete na adresu: lucie.langerova@ibt.cas.cz

Datum nástupu do zaměstnání: dle dohody

Pracoviště: GeneCore BIOCEV, Průmyslová 595, 252 50 Vestec

Více informací o centru naleznete na: www.biocev.eu

                                                                                                                

PhD and MSc students

 

Laboratory of Gene Expression is looking for two PhD and MSc candidates with an expected starting date for summer/autumn 2018.

Students will participate on projects focused on molecular and developmental biology.

 

Laboratory: The Laboratory of Gene Expression is a well-funded research laboratory with an excellent publication track record and comprise of researchers with unique scientific expertise. We focus on gene expression studies using a combination of up-to date techniques such as single cell expression profiling and NGS. We also utilize good biological models to help explain aspects of embryonic development, neurodegenerative diseases and cancer progression. The laboratory is located in the new state-of-the-art BIOCEV research center.

 

Qualification: Applicants should have a background in biochemistry, physiology, molecular or cell biology and bioinformatics. We seek a highly motivated, creative person, with strong interest in solving scientific problems.

 

Projects:

  • MicroRNA in central nervous system injury: potential roles and therapeutic implications. To understand the mechanisms underlying gene alterations following spinal cord injury and ischemic stroke, the successful candidate will examine temporal expression of miRNAs and mRNAs in the nervous tissue in mice and rat models using RNA sequencing and RT-qPCR analysis. The most promising miRNA-mRNA regulatory networks will be validated in vitro and in vivo using combination of tools for RNA, protein and functional analysis to verify true biological relevance of the findings. We are looking for candidate especially interested in large-scale data measurement and analysis.
  • In the second project we use frog animal model to study early development and biological processes such as wound healing and regeneration. Student is expected to perform a broad set of experiments from functional experiments including microinjections and micromanipulations of embryos, gene expression characterization to large-scale data measurement and analysis.

 

Contact: For application or further information please contact Dr. Radek Šindelka or Dr. Lukáš Valihrach:

Radek.Sindelka@ibt.cas.cz

Lukas.Valihrach@ibt.cas.cz

+420 325 873 748