Technologie pro strukturní a biofyzikální analýzu biomolekul
Centrum molekulární struktury
Provoz
Všechny přístroje jsou v provozu
Přístup do CMS jsou vyžadovány roušky. Prosíme dodržování vhodných hygienických návyků jako prevence COVID-19.
Prosíme, plánujte své experimenty po předchozí domluvě dostatečně dopředu.
Akce a školení
CMS na Twitteru
Novinky z CMS nyní můžete sledovat na Twitteru @CmsIbt
Nová CF Produkce proteinů
CMS bylo rozšířeno o jednotku specializovanou na rekombinantní produkci produkci proteinů. Více zde
Přihlašování projektů
Přihlašovaní projektů pro produkci proteinů je nyní možné pomocí standardního formuláře na webu CIISB. Detaily v zde.
Nové vybavení
Nový hmotnostní spektrometr
CF Hmotnostní spektrometrie byla posílena pořízením pčístroje timsTOF Pro.
Všestraný pipetovací robot OT-2
Řady přístrojů v CMS v červnu rozšířil pipetovací robot OT-2 od firmy Opentrons. Tato otevřená platforma umožňuje aplikace v celé řadě úloh. V CMS bude pomáhat zejm. při přípravě experimetů pro CF Biofyzikální Metody a CF Kraystalizace protein a nukleových kyselin.
Od uživatelů
Laboratoř Dr. Bouři (ÚOCHB Praha) realizovala měření pro svou studii komplexu SARS-CoV-2 methyltransferasy v difrakční facilitě CMS. Jejich výsledky publikované v Nat Commun 11, 3717 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-17495-9, ukazují vysokou konzervovanost aktivního místa tohoto komplexu mezi viry SARS-CoV-2 a SARS-CoV.
Centrum molekulární struktury (CMS) poskytuje špičkové vybavení, expertízu a služby pro charakterizaci biologických molekul a pro strukturní analýzu. CMS nabízí služby v režimu Open Access pro interní uživatele z BTÚ, pro ostatní akademické pracovníky a pro zákazníky z oblasti průmyslu. Pracoviště jsou provozována jako součást České infrastruktury pro integrativní strukturní biologii (CIISB) a patří pod české národní centrem evropské výzkumné infrastruktury INSTRUCT ERIC. Servisní pracoviště školí české a zahraniční studenty a mladé vědce formou různých workshopů po celý rok.
Servisní pracoviště Biofyzikální metody
Servisní pracoviště Biofyzikální metody umožňuje stanovení kvality, stability a interakčních vlastností stovek biomolekulárních vzorků v rámci mnoha strukturně-biologických projektů, ať už v rámci běžné kontroly kvality, detailní analýzy vlastností nebo optimalizace molekulárních konstruktů či pracovních protokolů.
Servisní pracoviště Krystalizace proteinů a nukleových kyselin
Servisní pracoviště Krystalizace proteinů a nukleových kyselin umožňuje uskutečnění tisíců krystalizačních pokusů za použití robotického nebo manuálního nasazování, automatický monitoring růstu krystalů, experimenty za zvolených teplot nebo za definovaných podmínek, za účelem přípravy vzorků k dalším krystalografickým studiím.
Servisní pracoviště Difrakční techniky
Servisní pracoviště Difrakční techniky se věnuje difrakční analyze a nabízí ověřování kvality krystalů, testování krystalů in situ, sběr a zpracování difrakčních dat z monokrystalů, měření maloúhlové difrakce (SAXS) s robotických nasazením vzorku a online UV-VIS detekcí, a zpracování dat ze SAXSu. Za rok jsou zpracovány stovky vzorků buď samotnými uživately nebo za pomoci našich zaměstnanců.
Servisní pracoviště Hmotnostní spektrometrie
Servisní pracoviště Hmotnostní spektrometrie poskytuje analýzu stovek vzorků a podporuje mnoho interních a externich strukturně-biologických projektů. Hlavním zaměřením služeb je monitorováni strukturních změn proteinů a protein-proteinové interakce pomocí chemického zesíťování a vodík-deuteriové výměny.
Poděkování
Centrum molekulární struktury je finančně podporováno z projektu MEYS (LM2018127), Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (CIISB), CIISB4HEALTH (CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_013/0001776), UP CIISB (CZ.02.1.01/0.0/0.0/18_046/0015974), a ELIBIO (CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000447)
Děkování v publikacích
Uživatelé Centra molekulární struktury jsou povidni v publikacích uvádět poděkování CIISB v následující formě: We acknowledge CMS-Biocev ("Biophysical techniques, Crystallization, Diffraction, Structural mass spectrometry”) supported by MEYS CR (LM2018127).
Jak se přihlásit k měření: https://stigmator.ceitec.muni.cz/project_form/
Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii https://www.ciisb.org/
Webové stránky CMS na BIOCEV https://www.biocev.eu/cs/infrastruktury-a-servisni-laboratore/centrum-molekularni-struktury.3
Konsorcium evropské výzkumné infrastruktury http://www.instruct-eric.eu/centre/biocev/
Prosím kontaktujte Ing. Jan Dohnálek, Ph.D. pro vice informací.
CF Biophysical methods
- Characterisation of intermolecular interactions
- Calorimetry
- Surface plasmon resonance
- Microscale thermophoresis
- Charcterisation of molecular state in solution
- CD spectrometry
- Dynamic light scattering
- Diferential scanning fluorescence
- Time resolved spectroscopies
CF Crystallization of Proteins and Nucleic Acids
- Classical and robotic crystallogenesis with remote experiment monitoring in three dedicated laboratories with strictly controlled temperature regimes with full backup
- Automated screening of variation of crystallization conditions and its effects
- Anaerobic crystallization and manipulation of biomacromolecules
CF Diffraction Methods
- Single crystal X-ray diffraction
- Cryo conditions
- Room temperature
- Controlled humidity or crysal dehydratation
- In-situ in crystallization plates
- Small angle X-ray scattering
- Characterization in solution
- Automatic measurements
- In-situ UV-Vis spectroscopy
- SEC-SAXS
CF Structural Mass Spectrometry
- Separation of protein mixtures
- Intact protein analysis
- Peptide/protein/metabolite profiling
- Protein identification
- Characterization of protein modifications
- Protein/metabolite quantification
- Protein surface covalent labelling
- Chemical cross-linking
- H/D exchange
- Data processing and interpretation of mass spectrometric data
CF Biophysical Methods
contact: Tatsiana Charnavets
- Surface Plasmon Resonance (SPR) system ProteOn XPR36 (BioRad)
- Circular dichroism (CD) spectrometer Chirascan Plus (Applied Photophysics)
- Monolith microscale thermophoresis (MST) NT.115 (Nano Temper)
- Monolith microscale label free thermophoresis NT.LabelFree (Nano Temper)
- Isothermal titration calorimeter MicroCal iTC200 (Malvern Panalytical)
- Dynamic light scattering (DLS) technique Zetasizer Nano ZS90 (Malvern Panalytical)
- Multi-angle dynamic light scattering (MADLS) technique Zetasizer Ultra (Malvern Panalytical)
- Differential scanning fluorescense (DSF) assay Prometheus NT.48 (Nano Temper)
- UV/Vis Spectrometer Specord 50 Plus (Analytica Jena)
- Modular fluorescence spectrometer FLS1000 (Edinburgh Instruments)
- with SuperK EXTREME, a supercontinuum white light laser (NKT Photonics)
- FTIR spectrometer Vertex 70v (Bruker)
CF Crystallization of proteins and nucleic acids
contact: Jiří Pavlíček
- Crystallization robots
- Gryphon (Art Robbins)
- NT8 (Formulatrix)
- General purpose pipetting robot OT-2 (Opentrons)
- Crystallization hotel RI1000 (Formulatrix)
- Stereomiroscopes (Olympus)
- Cold room, warm room
- Cryo storage for crystals
- Glovebox with stereomicroscope (GS)
- NanoDLS Spectrolight 600 (Molecular Dimenssions)
CF Diffraction techniques
contact: Jan Stránský
- D8 Venture (Bruker)
- MetalJet D2 X-ray source (Excillum)
- 4-circle goniometer
- Detector Photon II
- CryoStream 800 (OXford Cryoscience)
- In-situ plate holder ISX stage (Bruker)
- Hummidity control HClab (Arinax)
- SAXSpoint 2.0
- MetalJet C2+ Xray source (Excillum)
- Detector EIGER R 1M (Dectris)
- ASX autosampler
- CaryUV 60 (Agillent)
- AktaGO (GE Healthcare)
CF Structural Mass Spectrometry
contact: Petr Pompach
- 15T-SolariX XR FT-ICR mass spectrometer (Bruker Daltonics)
- HPLC, UPLC (Agilent Technoligies)
- Excimer laser (Coherent)
- MALDI-TOF (Bruker Daltonics)
Služby Centra molekulární struktury jsou dostupné i zájemcům z komerční sféry. Pro více detailů, prosím kontaktujte Jana Dohnálka.
Please edit the text block text